По смешанному контракту произвели таможенную очистку

Узбекское предприятие (субподрядчик) – плательщик налога с оборота по заключенному строительному (смешанному) экспортному контракту обязалось в качестве грузополучателя произвести для заказчика (генподрядчика) таможенную очистку импортных стройматериалов, поступающих на объект для выполнения работ по контракту. Субподрядчик, выполнив свои работы по контракту, завершив по ним взаиморасчеты, закрыл данный контракт в базе «Е-контракт». При этом субподрядчиком было упущено возмещение затрат по таможенной очистке (НДС на импорт, пошлина, таможенные процедуры). Таким образом, контракт закрыт, но в учете у субподрядчика осталась невозмещенной сумма затрат по таможенной очистке. Работа с инопартнером продолжается по идентичной работе, но уже по другому контракту. Подскажите варианты решения этого вопроса.