Периодические таможенные платежи НДС должны быть взяты в зачет плательщиками НДС

Наше предприятие приобрело в аренду строительные краны из Бельгии по договору аренды. Оформили режим ИМ-42 «Временный ввоз». В течение двух лет мы перечисляли периодические платежи по НДС. После того, как оплатили весь НДС, который был условно начислен во время растаможивания, поменяли режим на ИМ-40. Сама ГТД ИМ-40 отразилась в реестре покупок, но сумма НДС в ней не была указана и, следовательно, НДС в реестре покупок не отразился. Соответственно, мы не смогли воспользоваться своим правом и взять в зачет ранее уплаченный НДС. На наше письменное обращение в ГНК и ГТК мы получили лишь общие рекомендации, а не конкретный ответ, как поступить именно в нашей ситуации.