Бош бошқарма таркибида тизим ташкилотлари мавжуд бўлиб, улар республика ва ҳудудий муассасалардан иборат. Ўзбекистон Республикаси Вазирлар Маҳкамасининг 2016 йил 25 октябрдаги 361-сонли "Давлат ветеринария хизмати тизимини янада такомиллаштириш чора-тадбирлари тўғрисида"ги Қарорининг 3 иловасига асосан Ўзбекистон Республикаси Қишлоқ ва сув хўжалиги вазирлиги ҳузуридаги Давлат ветеринария бош бошқармаси тўғрисида низом тасдиқланган. Ушбу низомнинг 2-боб 11 моддаси а) бандининг 11 хатбошига асосан давлат ветеринария органлари ҳамда муассасаларига тегишли бўлган автотранспорт воситаларидан самарали фойдаланиш ишларини ташкил этиш ҳамда уларни фойдаланиш муддати ва техник ҳолатидан келиб чиқиб белгиланган тартибда ҳисобдан чиқариш кўрсатиб ўтилган.